Com a oferta de Clubes, o Externato de Penafirme pretende proporcionar à comunidade escolar uma oferta diversificada de contactos com temas essenciais ao desenvolvimento pessoal dos alunos, abarcando um grande número de áreas do saber, do saber estar, do saber fazer e do saber ser. São exemplos de clubes: Teatro, Guitarra, Coro, Clube do Dinheiro - O meu primeiro Milhão, Culinária e Cerâmica.

O facto de estas atividades decorrerem após o término das aulas é uma resposta efetiva à necessidade de muitas famílias, dado o frequente desajustamento entre o horário laboral dos pais e o horário letivo dos seus filhos.